Virus Zika ditularkan melalui gigitan nyamuk Aedes, dapat dalam jenis Aedes aegypti untuk daerah tropis, Aedes africanus di Afrika, dan juga Aedes albopictus pada beberapa daerah lain. Nyamuk Aedes merupakan jenis nyamuk yang aktif di siang hari, dan dapat hidup di dalam maupun luar ruangan. Selain itu, nyamuk Culex juga berpotensi untuk menularkan penyakit virus Zika.
Virus Zika juga bisa ditularkan melalui hubungan seksual, pada beberapa kasus virus Zika juga ditemukan di dalam cairan tubuh penderita (seperti cairan semen, darah, urine, air ketuban ibu hamil, air liur, serta cairan di dalam otak dan batang otak).